مدیریت مالی و ذیحسابی با هدف پشتیبانی مالی از طرحها و برنامههای دبیرخانه شوراي عالي ایجاد شده است و پیشبینی بودجه براساس هزینهیابی واقعی و بودجهریزی عملکردی، تهیه و تنظیم موافقتنامه بودجه، پیگیری تخصیص بودجه و درخواست وجه، تنظیم اسناد هزینهای پرسنلی و غیرپرسنلی، اسناد تملک داراییهای سرمایهای، رسیدگی و پرداخت و بایگانی اسناد، پیگیری کسورات بیمه، بازنشستگی، مالیات و بانکها و صندوقها، تنظیم قراردادها، رسیدگی، پرداخت و تسویه حساب نهایی، تهیه و گزارش عملکردهاوصورتحسابهای مالی و ارسال به مراجع و...